分子模型軟體
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BIOVIA Materials Studio 多尺度分子力學模擬工具
https://www.gga.asia
集大成的古典力學模擬軟體. Materials Studio針對各種材料提供如分子動力學(Molecular Dynamics, MD)與耗散粒子動力學(Dissipative Particle Dynamics, ...
Build a Molecule
https://phet.colorado.edu
從原子開始，看看您可以建立多少分子。收集您的分子，並檢視其3D 結構！ 翻譯者: Amber Chang (2011) HTML5 版本之翻譯： 翁佳驥(2016~)
CrystalMaker
https://crystalmaker.softhome.
完美之晶體及分子結構視覺化軟體，可以將晶體切片，產生晶面，可以移動編輯分離刪除原子及結合鍵，可以測量鍵之距離及角度，模擬X-ray光及中子繞射型式，並可輸出成高 ...
分子建模
https://zh.wikipedia.org
分子建模軟體</b>Agile Molecule （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）AMBER.BALLView.CHARMM.Cerius2.GAUSSIAN.Ghemical.GROMOS.更多項目...
分子模型软件
https://www.chemdraw.com.cn
作为一款三维分子结构演示软件，ChemBio 3D能够高效快捷地进行化学模型的制作和编辑。本教程将以十肽菌素分子模型的建立为例向大家讲解如何利用子结构建立ChemBio 3D模型。
分子視覺化軟體
http://ibm4.life.nthu.edu.tw
◇RasMol 讀取描述分子立體結構的原子座標檔,. 將分子的立體結構, 藉由生動的顏色及模型, 以. 互動的形式展現在電腦螢幕上。
可將分子結構轉成ARVR和可3D列印模型軟體RealityConvert
https://www.pcschool.com.tw
RealityConvert軟體，只要簡單地輸入某分子結構，就能自動將其轉化成相容3D列印機或AR/VR平台的高質量3D模型。 讓使用者能夠輕鬆地將分子轉換成3D列印和AR/VR模型.
在App Store 上的「分子模型」
https://apps.apple.com
簡介. 本程序利用PubChem和Protein Data Bank上的分子数据进行绘图，以3D的形式模拟一个分子的结构。 可以选择填充模式或球棍模式显示。 也可以自己搜索想 ...
蛋白質結構視覺化分析
https://lions.nchc.org.tw
ROSETTA, 蛋白質3D結構模擬與設計, 多CPU ; HADDOCK, 蛋白質分子對接模擬, 單CPU ; NAMD, 蛋白質分子動力學模擬, CPU+GPU混合計算 ; Gromacs, 蛋白質分子動力學模擬, CPU+GPU ...
電腦模擬
https://lions.nchc.org.tw
AutoDock/Vina, 小分子/蛋白質分子對接模擬, 單CPU ; Gaussian16, 量子化學計算模擬, GPU ; DiscoveryStudio, 小分子藥物設計, 單CPU (部分支援GPU) ; Schrodinger, 小分子 ...