whole genome sequencing原理：全基因組定序

全基因組定序

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霰彈槍定序法的流程圖顯示基因定序結果的電泳圖譜[1]

全基因組定序（Whole genome sequencing，WGS）是將一個生物的基因組完整（或接近完整）定序的流程。1990年代起陸續有生物的基因組被完整定序，最早被定序完成的生物為流感嗜血桿菌（1995年），1996年首次有真核生物（釀酒酵母）被完整定序。2014年以後全基因組定序逐漸開始被用於臨床用途[2][3][4]，以病人基因組資訊決定其療法，即個人化醫療[5]。2000年全基因體定序技術獲《科學》期刊選為該年的年度突破[6]。

流感嗜血桿菌為第一個被全基因組定序的生物秀麗隱桿線蟲為第一個被全基因組定序的多細胞生物（動物）阿拉伯芥為第一個被全基因組定序的植物

1977年，弗雷德里克·桑格的團隊將ΦX174噬菌體的基因組完整定序，長5368bp，是第一個被完整定序的基因組[7][8][9]。1990年代起定序技術逐漸成熟，開始被用於定序生物的完整基因組[10]。第一個被完整定序的生物為流感嗜血桿菌，共長183萬bp，於1995年由霰彈槍定序法完成[11]，隨後有其他細菌與古菌的基因組陸續被以相同方法定序。真核生物的基因組大小則大的多，因此定序較為困難，1996年釀酒酵母的基因組定序完成，約長1200萬bp，為第一個被完整定序的真核生物[12]；1998年秀麗隱桿線蟲的基因組被完整定序，為第一個完成定序的多細胞真核生物[13]。真核生物定序的方式除使用霰彈槍定序法外，還用到了細菌人工染色體（BAC）、酵母菌人工染色體（YAC）等基因文庫[14]。

1999年人類22號染色體（最短的體染色體）被定序發表[15]；2000年黑腹果蠅的基因組被完整定序，為第二種被完整定序的動物[16]，同年阿拉伯芥的基因組定序也告完成，是第一個被完整定序的植物[17]。2001年人類基因組計劃發表人類基因組的定序草圖（draft）[18]，2003年宣告真染色質的序列皆定序完成[19][20]，2021年發表定序程度達「完整」的基因組[21][22]；2002年小鼠的基因組也被定序發表[23]。目前已有上千種生物的基因組被完整定序。2005年起桑格定序等傳統的定序方法逐漸被Illumina染料定序、...

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