contigs中文:基因组拼接中常见的名词解释

基因组拼接中常见的名词解释

基因组拼接中常见的名词解释

Contig:拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。Scaffold:基因组denovo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往还需要构建454Paired ...。其他文章還包含有:「contig」、「N50、L50和相關統計學」、「NGS次世代定序常用名詞」、「从零开始生物信息学(5)」、「克隆重叠群」、「利用基因體重組決定序列片段的次序與方向」、「基因家族scaffoldcontigmotif」、「高通量测序中的reads、contig...

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contig
contig

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Contig是一个单个文件碎片整理程序,其目的是使磁盘上的文件保持连续。对于持续被碎片化的文件,或者如果您希望确保碎片数量尽量少,它可以完美地迅速优化文件。

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N50、L50和相關統計學
N50、L50和相關統計學

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NGS 次世代定序常用名詞
NGS 次世代定序常用名詞

https://www.zgenebio.com.tw

Contig N50:Reads 拼接後會獲得一些不同長度的Contigs。將所有的Contig 長度相加 ... 舉例:Contig 1+Contig 2+ Contig 3 +Contig 4=Contig 總長度*1/2 時,Contig 4 ...

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从零开始生物信息学(5)
从零开始生物信息学(5)

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contig:中文叫做重叠群,就是不同reads之间的overlap交叠区,拼接成的序列就是contig; scaffold:这是比contig还要长的序列,获得contig之后还需要构建 ...

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克隆重叠群
克隆重叠群

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克隆重叠群(clone contig),又叫克隆叠连群,是在基因测序中的一个概念。 中文名. 克隆重叠群. 外文名. clone contig. 别名. 克隆叠连群. 性质. 基因测序中的一个概念.

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利用基因體重組決定序列片段的次序與方向
利用基因體重組決定序列片段的次序與方向

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DNA定序技術的持續進步使得大量的基因體草圖能以較低的成本被快速地定序出來。然而這些基因體草圖通常僅是一些被部分定序成未組裝的序列片段(又稱contigs) 的集合, ...

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基因家族scaffold contig motif
基因家族scaffold contig motif

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... 中文文献直接把DNA序列的motif成为转录因子结合位点,然而我看很多英文文献DNA中的motif就是指DNA序列的一种频繁模式。我想请教一下这种广义上来讲的 ...

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高通量测序中的reads、contig、scaffold什么意思?
高通量测序中的reads、contig、scaffold什么意思?

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有很多reads通过片段重叠,能够组装成一个更大的片段,称为contig,它们是(片段)重叠群;就是不同reads之间的overlap(交叠区),拼接成的序列就是contig ...

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高通量测序中的reads、contig、scaffold什么意思?
高通量测序中的reads、contig、scaffold什么意思?

https://www.cnblogs.com

有很多reads通过片段重叠,能够组装成一个更大的片段,称为contig,它们是(片段)重叠群;就是不同reads之间的overlap(交叠区),拼接成的序列就是contig ...